“以中醫(yī)藥理論與實(shí)踐經(jīng)驗(yàn)為主體，研究人類生命活動(dòng)中醫(yī)學(xué)中健康與疾病轉(zhuǎn)化規(guī)律及其預(yù)防、診斷、治療、康復(fù)和保健的綜合性科學(xué)”。中醫(yī)學(xué)屬于在陰陽(yáng)五行理論指導(dǎo)下、從動(dòng)態(tài)整體角度研究人體生理病理藥理及其與自然環(huán)境關(guān)系、尋求防治疾病最有效方法的學(xué)問。任何一種理論，如果不具備整體觀念的特色，它就不會(huì)是完全意義上的中醫(yī)學(xué)，具備了整體觀念若是還不具備動(dòng)態(tài)的性質(zhì)，那么，這種理論也就還沒有完全把握到中醫(yī)學(xué)的真諦。“整體觀念”和“辨證論治”是中醫(yī)理論的基本特色，但現(xiàn)有的中醫(yī)學(xué)，除了《中醫(yī)生理病理系統(tǒng)論》，幾乎還沒有人能達(dá)到這樣的能全方位的突出“整體觀念”和“辨證論治”特色的，既能揭示臟腑的陰陽(yáng)氣化規(guī)律、溝通與天地陰陽(yáng)氣化規(guī)律聯(lián)系，又能揭示疾病的證侯規(guī)律的理論體系。 比如說中醫(yī)學(xué)有從整體觀念角度形成的“正氣與邪氣是構(gòu)成疾病的基本矛盾”的概念，按理說這應(yīng)該是中醫(yī)確定病名的理論依據(jù)。然而，由于其幾乎喪失了陰陽(yáng)五行理論對(duì)其的指導(dǎo)作用與價(jià)值，必然就分不清“病因”與“證因”的區(qū)別與聯(lián)系，意識(shí)到“病”和“證”是構(gòu)成疾病的基本要素，而是把“病因”與“證因”混為一談，甚至最后連病癥這些分別處于不同邏輯范疇的概念也混淆。然而，陰陽(yáng)五行屬于中國(guó)古代哲學(xué)范疇，將哲學(xué)和醫(yī)學(xué)混為一談，這使得部分人不能信服，也成為了質(zhì)疑其科學(xué)性者的把柄。